Дочерняя компания является самостоятельным юридическим лицом, которое все свои обязательства исполняет самостоятельно. Поэтому, для того чтобы оплачивать материалы для ремонта здания, принадлежащего дочерней компании, необходимо гражданско-правовое обоснование-Договор (Займа, поручения и др.)

С точки зрения налогового законодательства, в соответствии с п. 1 ст. 252 НК РФ налогоплательщик (материнская компания) вправе включить произведенные затраты в состав расходов, в случае если они экономически обоснованы, документально подтверждены и направлены на получение дохода. Позиция проверяющих органов на сегодняшний день такова- расходы, понесенные в интересах дочерних организаций, не могут быть признаны экономически обоснованными.

При этом, есть судебные решения, где налогоплательщику удалось доказать экономическую обоснованность расходов, понесенных в интересах дочерней компании. Поэтому в том случае, если материнская компания примет указанные расходы в целях налогообложения, скорее всего, свою позицию придется отстаивать в судебном порядке.